一、合同备案基本程序：  
   经贸部门审批  
   --> 向海关服务中心购买空白《登记手册》
   --> 合同预录入  
   --> 海关审核后开具《开设保证金台帐联系单》  
   --> 向中国银行申请设立台帐 ---> 海关核注银行签发的《台帐登记通知单》  
   --> 海关进行计算机异地传输 ---> 收到传输成功回执后核发《登记手册》。  
   二、合同备案所需单证：  
   1、经营单位申请报告。  
   2、外经贸主管部门《批准证》，属于进料加工的需要加盖税务部门印章。  
   3、对外签订的进出口合同。  
   4、经营单位基本帐户开立证明。  来源:报关员培训网
   5、加工企业所在地经贸部门出具的《加工生产能力证明》。  
   6、委托加工应提供经营单位与加工企业签定的符合《中华人民共和国合同法》的委托加工合同（协议）。  
   7、开展异地加工贸易，须提供经营单位所在地海关出具的关封，内含《异地加工申请表》一式二份。  
   8、首次开展加工贸易须提供经营单位和加工企业的《营业执照》、《税务登记证》复印件及《海关登记通知书》。  
   9、经营单位的介绍信或委托书。  
   10、加工工艺说明。  
   11、如需异地口岸进出口报关，须填写《异地报关申请表》。  
   12、海关需要的其他资料。  
   注：1）海关对首次开展加工贸易的企业实行验厂制度；对单证齐全、验厂合格的企业，海关在3个工作日内核发《登记手册》。  
   2）办理加工贸易合同备案的企业属AA类的，免设台帐；属A类企业的，需设台帐，实行“空转”；属B类企业的，需设台帐，一般商品实行“空转”，限制类商品实行“实转”；属C类企业的，需设台帐，一律实行“实转”；D类企业不得开展加工贸易业务。经营单位与加工企业非同一分类的，海关按就低不就高的原则管理。对外商提供的进口辅料品种在规定范围内，且金额在5000美金以下的，免办手册，不纳入台帐管理。  
   三、办理5000美元以下78种客供辅料备案手续所需单证：  
   1、申请报告。  
   2、进口发票、装箱单（一式二份）。  
   3、出口合同（一式二份）。  
   4、经营单位介绍信或委托书。  
   四、合同核销  
   （一）基本流程：  
   合同执行完毕后一个月内企业向海关申请核销  
   --> 预录入  
   --> 海关审核  
   --> 签发《台帐核销联系单》  
   --> 中国银行销帐  
   --> 海关核销结案  
   --> 打印结案通知书。  
   注：企业必须在海关规定的期限内向海关办理核销手续。对无正当理由未向海关办理核销手续的，海关根据有关规定进行处罚。  
   （二）所需单证  
   1、经营单位申请核销报告。  
   2、进出口报关单。  
   3、《登记手册》。  
   4、海关需要的其他单证，如核算表、划料图等反映实际加工情况的资料。